国交省チェッカーで報告書のPDFがフォントが埋め込まれています。特殊はフォントを使用していますとエラーになります。

国交省CALS Q&A　D-140　参照
A:フォントの埋め込みとは、どのようになると埋め込まれるのでしょうか。
Q:報告書オリジナルファイルから報告書PDFファイルを作成する際、オリジナルファイルで利用しているフォントをPDFファイルに継承するように設定して変換することを指しています。なお、要領(案)[H16.6]以降、報告書PDFファイルを作成する際はフォントを埋め込まないことと規定しています。(H21.3.30)
とあります。基準案に「不要なフォントの埋め込みは行わない。また、特殊なフォントは用いない」とあります。PDFを変換するときの設定に埋め込みの設定があると思います。（HPで「PDF　フォント　埋め込み　なし」検索するといろいろ出てきます。）アンテナハウスPDFドライバーだと初期設定では埋め込みはされない設定になっておりますので、そちらを利用してPDF変換してみてはいかがでしょうか？