成果管理にてファイルを格納したが、MEDIAの中が空で出力されます。

成果管理でファイルを格納後、測量電子納品出力せずに、電納編集ツールの呼び出ししただけではないでしょうか？成果管理で成果ファイルは格納したとのことだったので、測量電子納品出力から既存追加で電納編集ツールへ入り、電子納品出力するとMEDIAの中身も正しく出力されます。