IP法で計算していますが、中間点が赤色表示しているところがあります。

オーバハングしています。

ワーク入力画面の右にあるオーバーハング　チェックするにチェックを付けて[詳細]をクリックするとオーバーハングした距離が表示されます。
※距離が「0.000」となっている場合は、計算上でmm以下のオーバーハングです。
　　印刷の横の[条件]をクリックして「同一座標判定距離」の数値を大きくして同一座標と判定させると
　　オーバーハングが解除されます。
※距離が大きい場合は、IP点の座標及びパラメーターで路線が成り立っていません。
　　座標及びパラメータを確認してください。