登記情報取得をしようとすると「ログインできません」となります。レジストリをリネームしたユーザーですが、影響があるのでしょうか？

登記情報取得ログインではレジストリを見ていませんので、影響はありません。ID、パスワードの期限がきれていないか、パスワードが14文字以上に設定されていないか、セキュリティソフトでのファイル除外設定などを確認ください。