地区が違う厳密網の計算を同じ現場で計算してもよいか。

計算はできますが、基準点登録で、平均標高・ジオイド高・縮尺係数を計算するときは関係ない既知点は不計算に変更する必要がある点と、多角計算で使用する平均縮尺係数は現場情報に1つしか持たせらない点等がありませので、現場をわけたほうが間違いがないと思います。