例えば3本の単路線を水準網計算で、１つのワークで計算するのと、3つの単路線を１のワークで計算するのと成果は違ってきますか？

成果は変わりません。ただし、既知点登録に既知点が登録されていること、種別を単に設定してください。
水準平均計算の表紙の単位重量の標準偏差は、1本づつ計算するのと、3本一緒に計算するのとでは違ってきます。